惠安县医院内科分为内一区，内二区和内三区。
内一区于1982年组建，现有病床60张，主任医师2名，副主任医师3名，主治医师1名，住院医师3名，主管护师7名，护士13 名，科室主任张跃清主任医师，副主任张进辉副主任医师，主要专业为：消化内科，血液内科，内分泌内科。目前开展的诊疗范围为：急慢性消化系统疾病疑难危重病人抢救及诊治工作。如：消化道大出血的抢救，重症胰腺炎，肝硬化顽固性腹水，食道癌的介入治疗，还开展电子胃肠镜及无痛胃肠镜。C14尿素呼气试验检查幽门螺杆菌，胃镜食管扩张术，胃镜食管支架植入术，内镜高频电凝电切治疗。内分泌疾病常见疾病的诊治工作，糖尿病的筛查，胰岛素泵的应用。各种血液系统的诊治及肿瘤的化疗。
惠安县医院内二区由神经、肾脏两个专业组成，是该院重点科室。现有编制床位50张，在编人员38人，拥有中高级以上职称8人，其中主任医师3人，副主任医师2人，副主任护师1人，主治医师2人，拥有较先进的治疗设备，如美国伟康ESPRIT呼吸机，美国太空心电监护仪、脑电图、日本NIPRO血液透析机14台、德国费森尤斯血液透析机1台、肾脏穿刺活检设备等。目前，该科室能开展脑血栓静脉溶栓术、颅内血肿微创清除术、血液透析治疗术、亚低温治疗等多种较先进的诊疗技术。对神经科、肾内科各种疾病的诊治均有较丰富的临床经验。在脑血管病、头痛、眩晕、癫痫、帕金森病、痴呆、周围神经病、脊髓疾
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病、神经系统的感染性疾病以及尿毒症等方面具有较高的诊治水平。科主任陈子卿主任医师还担任福建省中西医结合学会神经病学 分会委员，福建省中西医结合学会脑心同治委员会委员，泉州市医学会神经病学分会常务委员，泉州市康复医学会理事会理事；杨银泉及许一兵副主任医师均担任泉州市医学会肾脏病移植、透析分会委员。陈子卿主任荣获卫生部全国脑血管防治办“微创技术推广奖”、 惠安县“科技进步二等奖”及惠安县“十佳科技创新标兵”、惠安县“老干部工作先进工作者”、泉州市卫生局“行风建设先进个人”等荣誉称号，2010年入选《泉州市百名医疗精英风采录》，《海峡都市报》曾专版介绍其治病救人的先进事迹；老主任张水生主任医师2005年被惠安县人民政府授予“惠安县卫生系统先进工作者”荣誉称号；杨银泉副主任医师在征兵工作中表现突出，被惠安县人民政府评为2011年度“先进个人”、被泉州市人民政府评为2013年度“先进个人”；2006年4月陈伟忠主任医师、庄碧玲副主任护师代表该院参加“泉州市医疗岗位练兵竞赛”中荣“获团体二等奖”；该科青年骨干医师郑丁还2011年9月参加由福建省卫生厅、总工会联合举办的“2011年全省青年医师、护士临床岗位技能竞赛”中荣获县级综合医院组内科专业个人一等奖，并为该院争得团体“工人先锋号”荣誉称号。他在2014.11代表该院参加由泉州市卫生局、总工会举办的“泉州市急诊急救岗位职工技能竞赛”中荣获“团体三等奖”；护士长庄碧玲副主任护师荣获2009年福建省“优秀护士”、2014年福建省“五四”劳动奖章。2009年内二科被惠安县委县政府授予“2006—2008年度创建文明行业工作先进单位”。科室在《中国危重病急救医学》、《中国医学工程》、《临床荟萃》《中国误诊学杂志》等多个国家级核心期刊发表十多篇论文。在省级杂志发表论文三十几篇。全科同仁决心以精湛的医疗技术，良好的医风医德，为广大患者提供优质的服务，打造优良品牌。
惠安县医院内三区拥有病床60张；专业医师12人，其中高级职称4人，中级职称6人，初级职称2人；护士21人，其中中级职称5人，初级职称16人。以心血管内科、呼吸内科、神经内科三个专业为重点的科室。科室全体成员团结协作，富有人性地关心每一位患者，本着求真、探索精神，遵循循证医学证据，力求科学、规范地完成各项临床工作任务。目前科室三个专业都比较成熟地开展了一些技术项目，有的项目甚至达到国内同行先进水平。心内科：高血压规范化管理、急性心肌梗死溶栓治疗、动脉粥样硬化性心血管病（ASCVD）的规范化管理、室性心动过速及室上性心动过速电复律、多入路临时起搏器及永久起搏器安装治疗、心衰Bipap呼吸机治疗技术、中心静脉压测定等。拟将进一步开展的项目有：心电运动平板实验、食道调搏技术、心房颤动电复律技术、冠心病运动康复治疗、肢体倾斜实验、冠心病多巴酚丁胺实验、床旁心脏超声检查技术等。呼吸内科：慢性阻塞性肺气肿（COPD）的规范化治疗、“难治性肺炎”的规范化诊治、肺癌规范化化疗、支气管镜检查与治疗技术、COPD无创及有创呼吸机治疗、小导管闭式引流治疗气胸及胸腔积液、CT定位下经皮胸膜穿刺活检及肺组织活检技术等。拟将进一步开展的项目有：支气管镜直视下介入治疗技术、支气管激发实验及舒张试验等。神经内科：神经系统疾病准确的定位、定性诊断、脑卒中规范化治疗、脑血管病脱水剂规范化治疗、偏头痛的临床治疗与预防、癫痫的规范化诊断与治疗、头痛与失眠的规范化诊断与治疗等。拟将进一步开展的项目有：脑卒中TCD监测，多导睡眠图的临床监测，功能磁共振在神经系统的诊断等。
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